Se como jogador Filipe Luís escreveu uma linda história com a camisa do Flamengo, como treinador ele já começou a carimbar o seu nome nas prateleiras do clube. Aliás, com o título da Copa Do Brasil, ele atingiu uma marca importante: o técnico que menos precisou de jogos para levantar uma taça pelo Rubro-Negro no século 21. No total, Filipe Luís dirigiu o Mais Querido em nove partidas, com seis vitórias, dois empates e uma derrota. Ele superou a marca de Ney Franco que, em 2006, conquistou o título da Copa do Brasil (o segundo do Flamengo) no 12° jogo no comando técnico da equipe. Filipe Luís se aposentou da carreira de jogador no final de 2023, após cinco anos com a camisa do Flamengo. Com o sonho de ser treinador, ele começou a nova carreira no sub-17 do Mais Querido. Na categoria, conquistou o título Carioca em cima do Vasco. No início de 2024, Filipe Luís foi convidado pela CBF para o cargo de coordenador de seleções. Ele, no entanto, recusou. Com a saída de Mário Jorge para o futebol árabe, ele assumiu o time sub-20 da base rubro-negra em junho. Na categoria, conquistou o título do Mundial de Clubes, batendo o Olympiacos, da Grécia, no Maracanã. Chegada ao time principal Com a demissão de Tite no final de setembro, a diretoria do Flamengo optou por uma opção caseira: efetivar o treinador da equipe sub-20.